Самыми крупными и сильными из мышц являются мышцы челюстей, из жевательных мышц особенно хорошо развита височная.

Наиболее важными являются мелкие, тонкие и хорошо дифференцированные мышцы, расположенные по ходу дыхательного тракта и функционирующие фонации. Вокруг наружного отверстия дыхала имеется множество мышц, служащих для его открывания; закрывается дыхало пассивно. Резко выступающая часть дыхала по своему виду напоминает «язык» («носовой клапан»). Это гибкая, эластичная ткань. Многие из этих мышц прикреплены к коже и другим тканям (костям, салу), лежащим впереди дыхала. Непосредственно под дыхалом расположены воздушные мешки. Ниже этих мешков воздухоносные пути разделяются костной носовой перегородкой.

Воздушные мешки имеют сложную систему мышц, отходящих во всех направлениях. Очевидно, эти мешки дают возможность издавать звуки под водой, а также в воздушной среде. В носоглотке расположен сфинктер, который сжимает верхние части гортанных хрящей, обеспечивая тем самым непрерывность дыхательных (воздухоносных) путей, пересекающихся с путями прохождения пищи. Этот хрящ отделяет воздухоносные пути от пищеварительной системы. В гортани множество мелких мышц. Чёткая нервная регуляция обеспечивает участие этих мышц в фонации и дыхании.